Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pkd2O35245 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms