Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pitx3O35160 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitx3O35160 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms