Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl4M0QW46 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms