Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5225J3QPL3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms