Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BC024978J3QPC3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC024978J3QPC3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms