Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lipo1J3QME6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms