Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200cJ3QK46 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem200cJ3QK46 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms