Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp17ldG5E8G2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp17ldG5E8G2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms