Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4933406M09RikG3XA12 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
4933406M09RikG3XA12 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4933406M09RikG3XA12 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4933406M09RikG3XA12 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4933406M09RikG3XA12 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
4933406M09RikG3XA12 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4933406M09RikG3XA12 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
4933406M09RikG3XA12 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
4933406M09RikG3XA12 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms