Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3tc1G3X9F6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3tc1G3X9F6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms