Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrna9G3X8Z7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrna9G3X8Z7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms