Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
D430041D05RikF6ZGR6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
D430041D05RikF6ZGR6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms