Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms