Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Crocc2F6XLV1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Crocc2F6XLV1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms