Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col22a1E9Q7P1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col22a1E9Q7P1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms