Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tarbp1E9Q368 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms