Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms