Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fndc1E9Q043 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms