Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chd2E9PZM4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms