Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5415E9PXF3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms