Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Soga1E1U8D0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga1E1U8D0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Soga1E1U8D0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms