Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930455H04RikD3Z622 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930455H04RikD3Z622 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms