Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930407I10RikD3Z5T8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930407I10RikD3Z5T8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms