Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L6

Slc18b1, MFS-type transporter SLC18B1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18b1D3Z5L6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18b1D3Z5L6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms