Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms