Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif28pD3YXS5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms