Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm4950D3YUM8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm4950D3YUM8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm4950D3YUM8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm4950D3YUM8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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