Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms