Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppfia1B2RXQ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia1B2RXQ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms