Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms