Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NhsB1AV60 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NhsB1AV60 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms