Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr29B1ARI9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms