Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Atp8b5A3FIN4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Atp8b5A3FIN4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Atp8b5A3FIN4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Atp8b5A3FIN4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Atp8b5A3FIN4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Atp8b5A3FIN4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Atp8b5A3FIN4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Atp8b5A3FIN4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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