Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga8A2ARA8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms