Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb1A2AQ07 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb1A2AQ07 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb1A2AQ07 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb1A2AQ07 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb1A2AQ07 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb1A2AQ07 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb1A2AQ07 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb1A2AQ07 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb1A2AQ07 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms