Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SetxA2AKX3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms