Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
VirmaA2AIV2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VirmaA2AIV2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VirmaA2AIV2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms