Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ambra1A2AH22 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ambra1A2AH22 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms