Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700023F06RikA2AB62 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms