Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calcoco2A2A6M5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calcoco2A2A6M5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms