Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp1bA1Z198 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms