Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71e1A1L3C1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms