Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms