Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms