Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Trbv21A0A0A6YX06 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trbv21A0A0A6YX06 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trbv21A0A0A6YX06 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trbv21A0A0A6YX06 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Trbv21A0A0A6YX06 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv21A0A0A6YX06 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv21A0A0A6YX06 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv21A0A0A6YX06 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv21A0A0A6YX06 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trbv21A0A0A6YX06 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trbv21A0A0A6YX06 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv21A0A0A6YX06 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trbv21A0A0A6YX06 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Trbv21A0A0A6YX06 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Trbv21A0A0A6YX06 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Trbv21A0A0A6YX06 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Trbv21A0A0A6YX06 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Trbv21A0A0A6YX06 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Trbv21A0A0A6YX06 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Trbv21A0A0A6YX06 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Trbv21A0A0A6YX06 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Trbv21A0A0A6YX06 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trbv21A0A0A6YX06 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms