Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp29Q9ES63 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 489 ms