Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sfrp1Q8C4U3 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sfrp1Q8C4U3 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sfrp1Q8C4U3 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sfrp1Q8C4U3 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sfrp1Q8C4U3 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sfrp1Q8C4U3 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Sfrp1Q8C4U3 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sfrp1Q8C4U3 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms