Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms