Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Rph3alQ768S4 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rph3alQ768S4 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rph3alQ768S4 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rph3alQ768S4 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rph3alQ768S4 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rph3alQ768S4 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rph3alQ768S4 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rph3alQ768S4 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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