Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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